為什麼論文寫作一定要學 Zotero？
Zotero 是免費開源的文獻管理工具，一鍵從瀏覽器存文獻、自動抓 metadata、輸出 BibTeX 搭配 Quarto 使用。
你現在的問題
你的文獻散落在各處：桌面有 30 個 PDF、下載資料夾有 50 個、Google Drive 有 20 個。檔名是 paper1.pdf、(2).pdf、Final version - Copy.pdf。你找不到上週讀的那篇，也記不得哪篇的 DOI 是什麼。
寫論文要引用的時候，你手動複製 APA 格式的引用，改完發現 A 期刊要 IEEE 格式，全部又要重改。
更危險的是：你用工具自動生成引用，結果有 30% 是假的，但你沒有一個可靠的文獻庫可以核對。
為什麼要學 Zotero？
1. 一鍵存文獻
安裝 Zotero Connector 瀏覽器擴充功能後，在任何學術網站（Google Scholar、PubMed、arXiv、期刊網站）只要點一下按鈕，文獻就自動存進 Zotero，連 PDF 都幫你下載。
2. 自動抓 metadata
存進 Zotero 的文獻會自動擷取：作者、標題、期刊、年份、DOI、摘要。你不需要手動輸入任何一項。如果 metadata 不完整，Zotero 可以透過 DOI 從 CrossRef 自動補齊。
3. BibTeX 輸出
Zotero 可以輸出 .bib 檔案，搭配 Markdown + Quarto 使用，引用只需要寫 [@chen2024]，render 時自動生成完整的引用格式。換期刊？換 CSL 樣式檔就好，不需要手動改任何引用。
4. 四種匯入方式
| 方式 | 場景 |
|---|---|
| 瀏覽器 Connector | 在學術網站一鍵存入 |
| DOI / ISBN 輸入 | 知道 DOI 就能存，自動抓所有資訊 |
| PDF 匯入 | 把 PDF 拖進 Zotero，自動辨識 metadata |
| BibTeX 匯入 | 從其他工具或 AI 生成的 .bib 檔匯入 |
5. 搭配 CrossRef API 驗證
Zotero 中的文獻都有 DOI，你可以用 CrossRef API 批次驗證所有 DOI 是否真實存在。這是杜絕 AI 假文獻的最後防線。
怎麼用？
基本工作流
- 安裝 Zotero 7 — 免費下載，支援 Windows/macOS/Linux
- 安裝瀏覽器 Connector — Chrome/Firefox/Safari 都有
- 建立分類資料夾 — 按研究主題或論文章節分類
- 日常使用 — 讀到好文獻，點一下 Connector 按鈕存入
- 寫論文時 — 匯出 BibTeX，在 Quarto 中引用
黃金規則
絕不添加
references.bib中不存在的引用。
這條規則的意思是：你的論文中的每一條引用，都必須來自你的 Zotero 文獻庫匯出的 .bib 檔案。AI 生成的引用如果在你的 Zotero 中找不到，就不能用。
這是防止假文獻混入論文的最簡單方法。
進階：三重驗證流程
- Zotero 有這篇嗎？ — 如果沒有，這個引用不可信
- DOI 在 CrossRef 查得到嗎？ —
api.crossref.org/works/{DOI} - 引用內容跟原文一致嗎？ — 用 NotebookLM 上傳 PDF 比對
在 12 Phase 中的角色
Zotero 貫穿整個研究流程：
| Phase | Zotero 的角色 |
|---|---|
| Phase 2 — 文獻調研 | 存入所有找到的文獻，建立文獻庫 |
| Phase 3 — 確認 Research Gap | 標記核心文獻（星號標記），分類整理 |
| Phase 6-9 — 撰寫 | 匯出 BibTeX，在論文中引用 |
| Phase 10 — 品質審查 | CrossRef API 驗證所有 DOI，確保無假文獻 |
| Phase 11 — 投稿準備 | 切換 CSL 樣式，一鍵轉換引用格式（APA → IEEE → Vancouver） |
常見問題
Q：已經在用 Endnote 需要換嗎？
看情況。Endnote 是付費軟體（通常學校買授權），畢業後可能就不能用了。Zotero 永久免費、開源、跨平台。如果你還在學，可以兩個並行，慢慢轉移。如果你要用 Markdown + Quarto 工作流，Zotero 的 BibTeX 匯出比 Endnote 順暢很多。
Q：Zotero 免費嗎？
軟體完全免費。雲端同步空間免費 300MB（夠存幾千篇文獻的 metadata），如果要同步 PDF 需要付費擴充空間（或用 WebDAV 自架）。大部分人 300MB 免費空間就夠用。
Q：AI 生成的引用可以直接匯入 Zotero 嗎？
可以，但強烈建議先驗證。把 AI 生成的 BibTeX 匯入 Zotero 後，用 DOI 查詢功能逐一驗證。查不到的就是假文獻，立刻刪除。
Q：Zotero 可以跟 Obsidian 搭配嗎？
可以。用 Zotero 的 Better BibTeX 插件，每次在 Zotero 新增文獻，自動更新 .bib 檔案。在 Obsidian 中用 Citations 插件，可以直接從 Zotero 文獻庫建立文獻筆記。兩者搭配是學術寫作的最強組合。